Kontrolujeme a posuzujeme hospodaření se státním majetkem i s finančními prostředky vybíranými na základě zákona. Nejvyšší kontrolní úřad má dále 9 územních odborů, které vykonávají kontrolní činnost v daném regionu.

Jsme ústřední orgán státní správy pro ochranu přírodního prostředí, ovzduší, zemědělského půdního fondu. Dále zajišťujeme ochranu pro dohled nad těžbou surovin, odpadové hospodářství a posuzování vlivů činností na životní prostředí. Poskytujeme informační sytém geologický a hydroekologický.