Zabýváme se kontrolou krmiv, půdy a výživy rostlin či živočišné produkce. Disponujeme laboratořemi k provádění chemických analýz. Zaměřujeme se na kontroly ekologického zemědělství a vydáváme výjimky pro použití konvenčního osiva a sadby. Organizujeme semináře a vydáváme odborné publikace.

Hydrobiologická stanice, která byla zřízena v roce 1924 v budově bývalé hájenky Prof. Karlem Schäffernou, je detašovaným pracovištěm přírodovědecké fakulty. Svým vznikem navázala na „létací“ stanici Prof. Friče založenou v roce 1988, která patřila k nejstarším podobným stanicím v Evropě.

Fakulta se zaměřuje na rybářství, akvakulturu, ochranu vod a komplexní systémy. Tvoří ji Výzkumný ústav rybářský a hydrobiologický a Ústav akvakultury. Je komplexním pracovištěm s bakalářským, magisterským a doktorským studiem. Zajišťujeme brigády, stáže a práce.