Najdete u nás stálé expozice Husité, Tábor - pevnost spravedlivých i královské město, gotický sál Staré radnice či vyhlídkovou věž Kotnov. Nabízíme výstavy, přednášky i přírodovědné a vlastivědné exkurze pro děti i dospělé. Spravujeme odborné knihovny a provádíme archeologické výzkumy.

Provozujeme expozici věnovanou historii české loutky a cirkusu.

Provozujeme městské muzeum. Prohlédnout si u nás můžete stálou expozici Rybářská tradice ve Vodňanech, která pojednává o rybníkářství, malířství, rybářském studiu a výzkumnictví. K vidění jsou preparáty ryb i rybářské náčiní. Pořádáme pravidelné výstavy prací fotografů a výtvarníků.

V muzeu je k vidění expozice dějin poštovnictví na našem území od r. 1526 do současnosti. Vystavuje se zde sbírka vozů, kočárů a saní z 19. století, historických poštovních stejnokrojů, schránek, výplatních a orážecích strojů.