Expozice muzea je věnována řece Otavě, místním přírodním poměrům, fauně a flóře, rýžování zlata, perlorodce říční a projektu Otavské plavby.

Provozujeme městské muzeum. Prohlédnout si u nás můžete stálou expozici Rybářská tradice ve Vodňanech, která pojednává o rybníkářství, malířství, rybářském studiu a výzkumnictví. K vidění jsou preparáty ryb i rybářské náčiní. Pořádáme pravidelné výstavy prací fotografů a výtvarníků.