Plavební úřad plní úkoly státní správy a státního dozoru ve vnitrozemské plavbě. Cílem je zabezpečit rozvoj, bezpečný a plynulý provoz. Vydáváme lodní osvědčení, cejchovní průkazy a průkazy způsobilosti. Provádíme technické prohlídky. Vybíráme správní poplatky.
Organizace a kontrola krizového řízení rezortu, zabezpečování úkolu ministerstva v oblasti civilního nouzového plánování, obranného plánování, hospodářské mobilizace zdrojů dopravy pro krizové stavy a v oblasti ochrany utajovaných skutečností.
Zabezpečení vnitřní a rezortní kontrolní činnosti, provádění finanční kontroly a zabezpečení interního auditu, organizování a plnění úkolů uložených ministrem a dalších úkolů vyplývajících z dožádání vnějších orgánů.
Provoz ústředního orgánu státní správy pro zemědělství, potravinářský průmysl, lesy, myslivost, rybářství a související oblasti. Provádíme opatření společných organizací trhů Evropské unie, národní doplňkové platby k přímým podporám, programy strukturální podpory a programy rozvoje venkova.
Ústřední orgán státní správy pro zabezpečování obrany státu. Řídí Armádu ČR a spravuje vojenské újezdy. Zajišťuje informační servis online. Ministerstvo se podílí na zpracování návrhu vojenské obranné politiky státu a připravuje koncepci operační přípravy státního území.
Plníme úkoly při zajišťování školských, vzdělávacích a dalších styků se zahraničím podle pokynů ministerstva. Provozujeme akademickou informační agenturu, zabývající se nabídkami stipendijních pobytů v zahraničí. Upevňujeme povědomí o českém kulturním dědictví.
Ministerstvo je ústředním orgánem státní správy ve věcech: regionální politiky, politiky bydlení, územního plánování, stavebního řádu, vyvlastnění, cestovního ruchu, realitní činnosti, pohřebnictví a veřejných dražeb.