Ústav je zaměřen zejména na dějiny v období od raného novověku do druhé světové války. Základní výzkum uskutečňuje v oboru českých, československých i obecných dějin a je součástí sítě domácích i zahraničních vědeckých, výzkumných a vysokoškolských institucí.

Zabýváme se výzkumem českého jazyka a jeho historie. Zaměřujeme se na oblast lingvistiky textu a rétoriky, řečové komunikace či řečového jednání. Vznikají zde pravidla pravopisu, slovníky, mluvnice, populárně-vědecká literatura i odborné publikace.

Zabýváme se vědeckým výzkumem v oblasti analytické chemie, zejména výzkumem analytických a bioanalytických mikrometod, nanometod a metod pro stanovení stopových koncentrací látek a vývojem přístrojové techniky jako základem ke zvýšení poznání a metodologické úrovně dalších vědních disciplín.

Provádíme výzkum v oblasti fyziologie a genetiky živočichů. Zaměřujeme se na studium unikátních vlastností domácích, divokých i laboratorních zvířat. Vedeme laboratoř vývojové biologie, biochemie a molekulární biologie zárodečných buněk, integrity DNA, embryologie živočichů, biologie nádorů a další.

Specializujeme se na výzkum sociálních a kulturních jevů týkajících se národů a etnických skupin. V současnosti je Etnologický ústav tvořen třemi badatelskými odděleními (historická etnologie, etnická studia, etnomuzikologie) a oddělením vědeckých informací.

Zajištění výzkumu v oblasti psychologie osobnosti, zdraví a kognitivní psychologie.

Jsme mezinárodně působícím výzkumným, vzdělávacím a informačním centrem. Naším posláním je podpora myslivosti a ochrany přírody ve středoevropském prostoru bez ohledu na státní hranice.

Zajišťujeme výzkum obratlovců na úrovních populace a společenstva. Specializujeme se na evoluční ekologii, biodiverzitu, aplikovanou ekologii a medicínskou zoologii. Přispíváme ke zvyšování úrovně poznání a vzdělanosti a k využití výsledků vědeckého výzkumu v praxi.

Zajišťujeme oddělení výzkumu, vývoje a doktorského studia.

Provozujeme analytické pracoviště zaměřené na aplikaci sociálněvědních poznatků v oblasti konkurenční schopnosti. Specializujeme se na analýzu zdrojů a výsledků konkurenční schopnosti České republiky a identifikaci souvisejících hospodářskopolitických implikací.

Oddělení zajišťuje výuku v oblasti matematické analýzy.

Oddělení zajišťuje výuku v oblasti genetiky a molekulární biologie. Specializuje se na bioetiku, buněčnou biologii, nukleové kyseliny, antropologii pro archeology, genetiku, molekulární cytogenetiku nebo dentální antropologii. Provádí výzkum buněčné diferenciace nebo molekulárních mikroorganismů.

Oddělení zajišťuje výuku v oblasti chemie se zaměřením na organickou chemii. Provádí výzkum zaměřený na způsoby syntézy, cyklizace reakce, reakční mechanismus nebo reaktivitu heterocyklických systémů.

Provádíme analýzu pevných vzorků laserovou ablací ve spojení s atomovou spektrometrií, vývoj plazmových zdrojů buzení pro spektrochemickou analýzu a diagnostiku analytických plazmat. Pro výzkum využíváme laserové ablační systémy, ICP-OES spektrometry, ICP-MS spektrometr a monochromátor.