Ústav je zaměřen zejména na dějiny v období od raného novověku do druhé světové války. Základní výzkum uskutečňuje v oboru českých, československých i obecných dějin a je součástí sítě domácích i zahraničních vědeckých, výzkumných a vysokoškolských institucí.

Zabýváme se teoretickým a experimentálním výzkumem v oboru mechaniky tuhé fáze se zaměřením na stavební konstrukce. Orientujeme se zejména na dynamiku konstrukcí, stochastickou dynamiku, aerodynamiku, aeroelasticitu, nelineární mechaniku a mechaniku materiálů.

Výzkum přípravy, vlastností a aplikací vybraných anorganických sloučenin.

Zabýváme se výzkumem a vývojem v oblasti přírodních a technických věd.

Provádíme výzkum v široké oblasti jaderné fyziky, jak experimentální tak teoretické. Zabýváme se také příbuznými vědními obory. Jsou studovány vybrané problémy teoretické subjaderné fyziky a matematické fyziky. Teorie jader je zaměřena na jadernou strukturu, hyperjádra a jiné.

Provádíme základní a aplikovaný výzkum v oblasti fotoniky, optoelektroniky a elektroniky. V těchto oblastech ÚFE rozšiřuje vědecké poznání a zabývá se vývojem nových špičkových technologií.

Zabýváme se vědeckým výzkumem fyziky plazmatu a jeho aplikacemi. Podílíme se na výzkumu a vývoji řízeného termojaderného slučování, využití elektrických výbojů, generátorů plazmatu, interakce plazmatu s jinými skupenstvími hmoty a likvidace odpadů v proudu plazmatu.

Provoz správního archivu.

Provádíme výzkum ve fyzice elementárních částic, kondenzovaných systémů, pevných látek, optiky a plazmatu. Výzkumné práce v oboru elementárních částic‭ ‬uskutečňujeme v rámci‭ ‬velkých mezinárodních kolaborací.‭ ‬Zabýváme se astročásticovou fyzikou. Věnujeme se interakci laserového záření s hmotou.

Předmětem hlavní činnosti Orientálního ústavu AV ČR je vědecký výzkum v oblasti orientalistiky. Zaměřujeme se zejména na dějiny národů Asie a Afriky, jakož i na jejich nábožensko-filozofické systémy, kulturu, jazyky a literaturu v období od starověku do současnosti.

Zajišťujeme výzkum kybernetiky a informatiky. Provádíme základní a aplikovaný výzkum na poli informatiky, zpracování signálů a obrazu, rozpoznávání obrazu, teorie systémů a teorie řízení.

Výzkum v oblastech technické fyziky se zaměřením na mechaniku tuhé a tekuté fáze a jejich interakce.