Provádíme výzkum v široké oblasti jaderné fyziky, jak experimentální tak teoretické. Zabýváme se také příbuznými vědními obory. Jsou studovány vybrané problémy teoretické subjaderné fyziky a matematické fyziky. Teorie jader je zaměřena na jadernou strukturu, hyperjádra a jiné.
Zabýváme se výzkumem a vývojem v oblasti jaderných technologií a nakládání s radioaktivními odpady v energetice a průmyslu. Provádíme výstavbu jaderných elektráren. Zaměřujeme se také na nukleární medicínu zejména v oblasti diagnostiky různých onemocnění.
Zajišťujeme výzkum složení a vývoje neživé přírody. K dispozici máme laboratoř analytických metod, environmentální geologie a geochemie, geologických procesů, paleobiologie, paleoekologie a paleomagnetismu.
Provádíme základní a aplikovaný výzkum v oblasti fotoniky, optoelektroniky a elektroniky. V těchto oblastech ÚFE rozšiřuje vědecké poznání a zabývá se vývojem nových špičkových technologií.
Poskytujeme odborné informační služby a zajišťujeme vzdělávací a výzkumnou činnost. Podporujeme výzkum, výuku a studium otázek evropské integrace. Zabýváme se monitorováním, získáváním a zpracováním evropských dokumentů, předpisů a právních norem.
Provádíme výzkum ve fyzice elementárních částic, kondenzovaných systémů, pevných látek, optiky a plazmatu. Výzkumné práce v oboru elementárních částic uskutečňujeme v rámci velkých mezinárodních kolaborací. Zabýváme se astročásticovou fyzikou. Věnujeme se interakci laserového záření s hmotou.
Zabýváme se vývojem a výrobou zařízení na úpravu pitné a technologické vody z jakéhokoli kontaminovaného vodního zdroje. Zajišťujeme poradenství k vyřešení problému s kontaminací vody. Nabízíme filtrační systémy, instalaci a servis.
Provozujeme centrum se zaměřením na architektonická, stavebně technická, ekologická a ekonomická kritéria výzkumu, záchranu a nového využití technických památek.
Provozujeme centrum zajišťující experimentální práce vědecko-výzkumné povahy vyplývající z potřeb výuky, grantové a vedlejší hospodářské činnosti. Zajišťujeme odborný servis stavebním firmám. Disponujeme materiálovými a zkušebními laboratořemi či měřicím a vyhodnocovacím střediskem.