Vedeme výzkum v oblastech organické chemie, biochemie a disciplínách z lékařského a životního prostředí. Podílíme se na vzdělávání na universitní úrovni a vedeme diplomové a doktorské práce. Zaměřujeme se na výzkum organické syntézy, antimikrobiálních peptidů, neuroprotektiv a dalších.

Zabýváme se výzkumem složení a vývoje neživé přírody. K dispozici máme laboratoř analytických metod, environmentální geologie a geochemie, geologických procesů, paleobiologie, paleoekologie a paleomagnetismu.

Výzkum českých a československých dějin po roce 1938 v mezinárodním kontextu. Pořádání mezinárodních konferencí, specializovaných sympozií a workshopů. Vydávání časopisu Soudobé dějiny.