Fakulta zdravotnických studií nabízí Bc. vzdělání v programech Fyzioterapie, Ergoterapie, Ortotika-protetika, Všeobecné ošetřovatelství, Porodní asistence, Radiologická asistence, Zdravotnické záchranářství, Laboratorní diagnostika ve zdravotnictví, Všeobecná sestra; Mgr. v programu Ošetřovatelství.

Fakulta pedagogická je nejstarší fakultou ZČU nabízející učitelské i neučitelské studijní programy (bakalářské, magisterské, navazující magisterské a doktorské). Zajišťuje i další vzdělávání pedagogických pracovníků, Dětskou univerzitu a nabízí i řadu kurzů a programů pro veřejnost.