Instituce dbá na zdraví zvířat, na zdravotní nezávadnost potravin a na ochranu státu před možným zavlečením nebezpečných nákaz nebo jejich nositelů. Zaměřujeme se na přímou a nepřímou ochranu zvířat proti týrání.

Zajišťujeme správu toku. Sledujeme stav koryt a splavnost. Provozujeme a udržujeme vodní díla, vodohospodářské laboratoře. Spolupracujeme při zneškodňování havárií. Spravujeme vodní elektrárny. Zabýváme se geodetickou činností, rybářstvím, kvalitou vody.

Zabýváme se kontrolou krmiv, půdy a výživy rostlin či živočišné produkce. Disponujeme laboratořemi k provádění chemických analýz. Zaměřujeme se na kontroly ekologického zemědělství a vydáváme výjimky pro použití konvenčního osiva a sadby. Organizujeme semináře a vydáváme odborné publikace.

Provozujeme muzejní knihovnu. Zaměřujeme se na půjčování odborné literatury se zaměřením na oblast archeologie, dějin, etnografie, památkové péče, umění, filmu, fotografie, hudby, knižní kultury a výtvarnictví pro veřejnost a studenty středních i vysokých škol.