Laboratoř bakteriologické kontroly provádí vyšetření sterility transfúzních přípravků a mikrobiologické vyšetření stěrů.

Cytogenetická laboratoř provádí klasická postnatální cytogenetická vyšetření, prenatální cytogenetická vyšetření a prenatální i postnatální molekulárně genetická vyšetření metodou fluorescenční in situ hybridizace.

Laboratoř DNA diagnostiky provádí postnatální i prenatální molekulárně genetická vyšetření.

Provoz elektroencefalografické laboratoře. Elektroencefalografie je diagnostická metoda spočívající v záznamu a vyhodnocení slabých elektrických proudů, které vycházejí z mozku.

V laboratoři provádíme vyšetření HLA, HPA, HNA a některých krevních systémů, např. ABO, Rh, Kell, Kid, Duffy metodou PCR - SSP (polymerázová řetězová reakce se sekvenčně specifickými primery).

Specializovaná nervosvalová ambulance a EMG laboratoř se věnuje diagnostice a následné terapii onemocnění z okruhu postižení periferního nervového systému.

Laboratoř provádí vyšetření buněk z veškerých tkání těla, zejména pak cytologická vyšetření plic, likvoru, moči, slinných žláz, štítné žlázy, GIT, prsů.

V laboratoři se provádí speciální barvící a impregnační metody jako jsou např. metody k průkazu tkáňových struktur, polysacharidů, pigmentů, bakterií či anorganických látek.

V laboratoři se provádí imunohistochemické a imunocytochemické metody ke zpřesnění diagnostiky nádorových onemocnění, k určení jejich histogeneze, popř. prediktivních a prognostických faktorů.

Laboratoř provádí vyšetřování infekčních markerů u dárců, těhotných žen a pacientů (HBsAg, anti HCV, Ag/Ab HIV, syfilis).

Ústav laboratorní diagnostiky poskytuje své služby v oblastech diagnositcké a léčebné péče, výchovně vzdělávací a vědecko-výzkumné činnosti. Organizují regionální a celostátní semináře pro své obory i pro další klinické obory ve FNO.

Provozujeme pracoviště spirometrie, rozšířené spirometrické pracoviště s rhinomanometrií a provokokačním testem, pracoviště pro měření funkčního vyšetřování plic při zátěži, EKG a ergometrie. Provádíme měření nepřímo měřitelných plicních objemů a proudových odporů, difúzní kapacity.

Provádíme především analýzy pro trestně právní účely na dožádání PČR. Pro civilní sektor pak provádíme vyšetření krve na alkohol na žádost zaměstnavatele v případě, že vznikne podezření na ovlivnění organismu alkoholem u zaměstnance a dále i pro soukromé účely.

EEG laboratoř slouží k vyšetření elektrických potenciálů mozku neinvazívním snímáním pomocí elektrod umístěných ve vlasové části hlavy speciální čepicí.