Provoz muzea mlynářství, o práci a životě ve mlýně, o výrobě elektřiny a elektrotechnice, o lokální historii, o řemeslech, fotografování a o spoustě dalších témat.

Regionální muzeum, jehož zřizovatelem je Jihočeský kraj. Světovým unikátem muzea jsou Krýzovy jesličky, největší lidový mechanický betlém na světě, který je od roku 1998 zapsán v Guinnessově knize rekordů. K dalším neméně zajímavým expozicím patří síň Emy Destinnové či Bitva nad Jindřichohradeckém.

Provozujeme kostel sv. Jana Křtitele a minoritský klášter. Gotický kostel je jednou ze starých památek města, byl budován od 3. čtvrtiny 13. století. Pořádáme zde výstavy a koncerty. Konají se zde i svatby. V přilehlé budově je konferenční sál využívaný pro přednášky, který si lze pronajmout.

Kostel sv. Jana Křtitele patří mezi velmi tajemná místa v Čechách. Bizarní nástěnné malby ze 14. st. , kombinace lidských a zvířecích těl, připomínající spíše chiméry z Bestiáře než zobrazení svatých. Najdeme zde i nahou ženu s prsy na zádech, démonické skřety a další. Jedná se o světový unikát.

Provoz muzea se stálou expozicí pojednávající o období od mladší doby kamenné až po raný středověk.