Propojuje špičkový výzkum s odbornými činnostmi. Poskytuje dlouhodobé geovědní informace pro ochranu zdrojů a udržitelný rozvoj. Hlavní činnosti: geologický výzkum a mapování, horninové prostředí, nerostné suroviny, podzemní voda, geologická rizika, správa a poskytování geovědních informací.

Pracoviště ČGS s centrální laboratoří – anorganická geochemie, geochemie horninového a životního prostředí a speciálními laboratořemi.