Zabýváme se zachováním a využíváním přírodních zdrojů. Zaměřujeme se na zlepšování vlastností, odolnosti a zdravotního stavu rostlin. Vedeme odbor genetiky, rostlinolékařství, agroekologie, výživy rostlin a polních pokusů. Vydáváme publikace a pořádáme výstavy. Poskytujeme odborné poradenství.

Zabýváme se kontrolou krmiv, půdy a výživy rostlin či živočišné produkce. Disponujeme laboratořemi k provádění chemických analýz. Zaměřujeme se na kontroly ekologického zemědělství a vydáváme výjimky pro použití konvenčního osiva a sadby. Organizujeme semináře a vydáváme odborné publikace.

Výzkumný ústav zodpovídá za rozvoj poznání a přenos poznatků vědních oborů ochrany půdy, komplexních meliorací, pedologie, tvorby a využití krajiny a informatiky k těmto oborům se vztahující. Provádí rozbory půdy a vody, provozuje geoportál SOWAC-GIS, tvoří mapy, poskytuje data.