Ústav je zaměřen zejména na dějiny v období od raného novověku do druhé světové války. Základní výzkum uskutečňuje v oboru českých, československých i obecných dějin a je součástí sítě domácích i zahraničních vědeckých, výzkumných a vysokoškolských institucí.

Výzkum v oblastech matematiky a jejich aplikací a zajišťování infrastruktury výzkumu.

Laboratoř shromažďující anorganické materiály. Spolupracuje s domácími i zahraničními pracovišti a vydává odborné publikace. Zabývá se výzkumem tavicích procesů a jejich modelování, speciálních skel pro fotoniku či materiálů pro dentální aplikace.

Národní filmový archiv je státní příspěvková organizace zřizovaná ministerstvem kultury. Pečuje o české filmové dědictví.