Pedagogická fakulta JU má tradici v přípravě učitelů již od roku 1948 a nabízí studium bakalářských, magisterských, doktorských studijních programů a také celoživotní vzdělávání. Fakulta má 3 areály převážně v historickém centru města, jde o největší fakultu Jihočeské univerzity.

Katedra zajišťuje výuku a výzkum v oblastech kinantropologie, které jsou úzce spojeny s biomedicínou, fyzikálními obory a motorikou člověka. Podílí se na realizaci prezenční i kombinované formy pregraduálního i doktorandského studia.

Fakulta nabízí bakalářský, magisterský i doktorský program chemie a technologie ochrany životního prostředí či magisterský program chemie a technologie paliv a prostředí. Spolupracuje se zahraničními vysokými školami v rámci projektu Erasmus.

Provozujeme vzdělávací instituci s nabídkou výuky bakalářských, magisterských a doktorských studijních programů včetně programů celoživotního vzdělávání. Poskytujeme možnost studia při zaměstnání. Zaměřujeme se na vzdělávání v ekonomickém a manažerském oboru či inženýrské pedagogice.

Soukromá vysoká škola s akreditovaným profesně zaměřeným bakalářským programem Logistika nabízí studium v prezenční i kombinované formě v oborech Logistika v dopravě, Logistika ve službách a Logistika pro informatiku a profesně zaměřeným studiem v navazujícím magisterském programu Logistika.

Prestižní vysoká škola zaměřená na výuku diplomacie, mezinárodních vztahů, politologie a public relations. Vyučují osobnosti z řad historiků, diplomatů, právníků, umělců a novinářů. Bakalářské a magisterské programy v prezenční i kombinované formě.

Fakulta poskytuje vysokoškolské vzdělání v bakalářských, magisterských, navazujících magisterských a doktorských studijních programech. Součástí fakulty jsou katedry dechových nástrojů, klávesových nástrojů, strunných nástrojů, sólového zpěvu, intermédií, grafiky a kresby, malby, sochařství a další.

Fakulta se skládá z kateder informatiky v dopravě, dopravních prostředků a diagnostiky, dopravního stavitelství, technologie a řízení dopravy, dopravního managementu, marketingu a logistiky či mechaniky, materiálů a částí stojů. Dále fakulta zahrnuje odborné ústavy, výzkumná centra a laboratoře.

Nabídka studia v oboru bezpečnostně právní studia, kriminalistika a forenzní disciplíny, policejní činnosti, policejní management a kriminalistik.

Fakulta zajišťuje výuku v oblasti všeobecného zemědělství, agroekologie či ochrany a tvorby životního prostředí.

Fakulta pedagogická je nejstarší fakultou ZČU nabízející učitelské i neučitelské studijní programy (bakalářské, magisterské, navazující magisterské a doktorské). Zajišťuje i další vzdělávání pedagogických pracovníků, Dětskou univerzitu a nabízí i řadu kurzů a programů pro veřejnost.

Provoz ústavu molekulární a translační medicíny.

Univerzita nabízí studium na fakultách agronomického, lesnického a dřevařského, provozně ekonomického či zahradnického zaměření i na fakultě regionálního rozvoje a mezinárodních studií. Možnost studia v rámci programu LLP/Erasmus. Provoz vysokoškolského sportovního klubu.